Метотрексат нь эсийн ДНХ-ийн нийлэгжилтэнд оролцдог дигидрофолат редуктазыг дарангуйлснаар эсийн хуваагдлыг саатуулан панцитопени үүсгэдэг. Энэ нь ясны чөмөгт үүсэх улаан эс, цагаан эс, ялтас эсийн үүсэлд нөлөөлдөг.